Highlighted
Inga-Maria Launonen, Iga Niemiec, María Hincapié-Otero, Erdogan Pekcan Erkan, Ada Junquera, Daria Afenteva, Matias M. Falco, Zhihan Liang, Matilda Salko, Foteini Chamchougia, Angela Szabo, Fernando Perez-Villatoro, Yilin Li, Giulia Micoli, Ashwini Nagaraj, Ulla-Maija Haltia, Essi Kahelin, Jaana Oikkonen, Johanna Hynninen, Anni Virtanen, Ajit J. Nirmal, Tuulia Vallius, Sampsa Hautaniemi, Peter K. Sorger, Anna Vähärautio*, Anniina Färkkilä*
*Corresponding authors
Cancer Cell 2024 , 42 (12): 2045-2063.e10
Dai J, Zheng S, Falco MM, Bao J, Eriksson J, Pikkusaari S, Forsten S, Jiang J, Wang W, Gao L, Perez-Villatoro F, Dufva O, Saeed K, Wang Jr Y, Amiryousefi A, Färkkilä A, Mustjoki S, Kauppi L, Tang J*, Vähärautio A*
Nature Communications 2024
Zhang K, Erkan EP, Jamalzadeh S, Dai J, Andersson N, Kaipio K, Lamminen T, Mansuri N, Huhtinen K, Carpén O, Hietanen S, Oikkonen J, Hynninen J, Virtanen A, Häkkinen A, Hautaniemi S*, Vähärautio A*
Science Advances 2022
All Publications
Jie Bao, Sanna Pikkusaari, Jun Dai, Samuel Leppiniemi, Wenjun Huang, Weiming Yang, Anu Anil, Mirva Pääkkönen, Chuqi Lei, Eva Daniela Mendoza-Ortiz, Ezgi Karagöz, Johanna Eriksson, Min Li, Johanna Hynninen, Otto Kauko, Anniina Färkkilä, Anna Vähärautio, Sampsa Hautaniemi, Liisa Kauppi, Jing Tang
Biomedicine & Pharmacotherapy 2025
Johanna Eriksson, Shuyu Zheng, Mihaela Popa, Jie Bao, Jun Dai, Wenyu Wang, Emmet McCormack, Anna Vähärautio, Jing Tang
Cancer Research 2025
- Dynamic and Ongoing De Novo L1 Retrotransposition Contributes to Genome Plasticity and Intrapatient Heterogeneity in Ovarian Cancer ↗︎
Barun Pradhan, Jaana Oikkonen, Kaiyang Zhang, Juan Manuel Botto, Minna R Eriksson, Srividhya Sundaresan, Fatih Genç, Thomas R Pisanic, Matias Marin Falco, Yilin Li, Sanna Pikkusaari, Kari Lavikka, Giulia Micoli, Giovanni Marchi, Taru A Muranen, Kaisa Huhtinen, Anna Vähärautio, Richard Badge, Kathleen H Burns, Sakari Hietanen, Johanna Hynninen, Geoffrey J Faulkner, Sampsa Hautaniemi, Liisa Kauppi
Cancer Research 2025
Giulia Micoli, Kari Lavikka, Yilin Li, Anna Pirttikoski, Daria Afenteva, Wojciech Senkowski, Giovanni Marchi, Anna Vähärautio, Taru A Muranen, Titta Joutsiniemi, Sakari Hietanen, Anni Virtanen, Krister Wennerberg, Johanna Hynninen, Jaana Oikkonen, Sampsa Hautaniemi
Cancer Discovery 2025
Daria Afenteva, Rong Yu, Anna Rajavuori, Marina Salvadores, Inga-Maria Launonen, Kari Lavikka, Kaiyang Zhang, Anna Pirttikoski, Giovanni Marchi, Sanaz Jamalzadeh, Veli-Matti Isoviita, Yilin Li, Giulia Micoli, Erdogan Pekcan Erkan, Matias M Falco, Daniela Ungureanu, Alexandra Lahtinen, Jaana Oikkonen, Sakari Hietanen, Anna Vähärautio, Inderpreet Sur, Anni Virtanen, Anniina Färkkilä, Johanna Hynninen, Taru A Muranen, Jussi Taipale, Sampsa Hautaniemi
Cell Reports Medicine 2025
Narjes Yazdi, Negar Pourjamal, Riku Katainen, Juho Väänänen, Jun Dai, Anna Vähärautio, Jorma Isola, Minna Kempas, Vadim Le Joncour, Pirjo Laakkonen, Heikki Joensuu, Mark Barok
Cancer Letters 2025
Anna Pirttikoski, Laura Gall-Mas, Wojciech Senkowski, David Fontaneda-Arenas, Matias Marin Falco, Erdogan Pekcan Erkan, Johanna Hynninen, Krister Wennerberg, Anna Vähärautio
Pre-print
Inga-Maria Launonen, Iga Niemiec, María Hincapié-Otero, Erdogan Pekcan Erkan, Ada Junquera, Daria Afenteva, Matias M. Falco, Zhihan Liang, Matilda Salko, Foteini Chamchougia, Angela Szabo, Fernando Perez-Villatoro, Yilin Li, Giulia Micoli, Ashwini Nagaraj, Ulla-Maija Haltia, Essi Kahelin, Jaana Oikkonen, Johanna Hynninen, Anni Virtanen, Ajit J. Nirmal, Tuulia Vallius, Sampsa Hautaniemi, Peter K. Sorger, Anna Vähärautio*, Anniina Färkkilä*
*Corresponding authors
Cancer Cell 2024 , 42 (12): 2045-2063.e10
Hwang S-M, Awasthi D, Jeong J, Sandoval TA, Chae C-S, Ramos Y, Tan C, Falco MM, Salvagno C, Emmanuelli A, McBain IT, Mishra B, Ivashkiv LB, Zamarin D, Cantillo E, Chapman-Davis E, Holcomb K, Morales DK, Yu X, Rodriguez PC, Conejo-Garcia JR, Kaczocha M, Vähärautio A, Song M&Cubillos-Ruiz JR*
Nature
Ianevski A, Nader K, Driva K, Senkowski W, Bulanova D, Moyano-Galceran L, Ruokoranta T, Kuusanmäki H, Ikonen N, Sergeev P, Vähä-Koskela M, Giri AK, Vähärautio A, Kontro M, Porkka K, Pitkänen E, Heckman CA, Wennerberg K, Aittokallio T*
Nat Commun. 2024, 15: 8579
Jamalzadeh S, Dai J, Lavikka K, Li Y, Jiang J, Huhtinen K, Virtanen A, Oikkonen J, Hietanen S, Hynninen J, Vähärautio A, Häkkinen A*, Hautaniemi S*
BMC Cancer. 2024: 24:173
Perkiö A, Pradhan B, Genc F, Pirttikoski A, Pikkusaari S, Erkan EP, Falco MM, Huhtinen K, Narva S, Hynninen J, Kauppi L*, Vähärautio A*
Scientific Reports 2024, 1;14:4322
Sandoval TA, Salvagno C, Chae CS, Awasthi D, Giovanelli P, Marin Falco M, Hwang SM, Teran-Cabanillas E, Suominen L, Yamazaki T, Kuo HH, Moyer JE, Martin ML, Manohar J, Kim K, Sierra MA, Ramos Y, Tan C, Emmanuelli A, Song M, Morales DK, Zamarin D, Frey MK, Cantillo E, Chapman-Davis E, Holcomb K, Mason CE, Galluzzi L, Zhou ZN, Vaharautio A, Cloonan SM, Cubillos-Ruiz JR*
Cancer Discovery 2024
Dai J, Zheng S, Falco MM, Bao J, Eriksson J, Pikkusaari S, Forsten S, Jiang J, Wang W, Gao L, Perez-Villatoro F, Dufva O, Saeed K, Wang Jr Y, Amiryousefi A, Färkkilä A, Mustjoki S, Kauppi L, Tang J*, Vähärautio A*
Nature Communications 2024
Senkowski W, Gall-Mas L, Falco MM, Li Y, Lavikka K, Kriegbaum MC, Oikkonen J, Bulanova D, Pietras EJ, Voßgröne K, Chen YJ, Erkan EP, Dai J, Lundgren A, Grønning Høg MK, Larsen IM, Lamminen T, Kaipio K, Huvila J, Virtanen A, Engelholm L, Christiansen P, Santoni-Rugiu E, Huhtinen K, Carpén O, Hynninen J, Hautaniemi S, Vähärautio A, Wennerberg K*
Developmental Cell 2023
Launonen, I-M., Vähärautio, A., & Färkkilä, A*
Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine. 2023
Zhang K, Erkan EP, Jamalzadeh S, Dai J, Andersson N, Kaipio K, Lamminen T, Mansuri N, Huhtinen K, Carpén O, Hietanen S, Oikkonen J, Hynninen J, Virtanen A, Häkkinen A, Hautaniemi S*, Vähärautio A*
Science Advances 2022
He L, Bulanova D, Oikkonen J, Häkkinen A, Zhang K, Zheng S, Wang W, Erkan EP, Carpén O, Joutsiniemi T, Hietanen S, Hynninen J, Huhtinen K, Hautaniemi S, Vähärautio A, Tang J, Wennerberg K, Aittokallio T*
Briefings in bioinformatics 2021
Hippen AA, Falco MM, Weber LM, Erkan EP, Zhang K, Doherty JA, Vähärautio A, Greene CS, Hicks SC*
PLoS computational biology 2021
Häkkinen A, Zhang K, Alkodsi A, Andersson N, Erkan EP, Dai J, Kaipio K, Lamminen T, Mansuri N, Huhtinen K, Vähärautio A, Carpén O, Hynninen J, Hietanen S, Lehtonen R, Hautaniemi S*
Bioinformatics 2021
- A Functional Homologous Recombination Assay Predicts Primary Chemotherapy Response and Long-Term Survival in Ovarian Cancer Patients ↗︎
Tumiati M,* Hietanen S, Hynninen J, Pietilä E, Färkkilä A, Kaipio K, Roering P, Huhtinen K, Alkodsi A, Li Y, Lehtonen R, Pekcan Erkan E, M. Tuominen M, Lehti K, K. Hautaniemi S, Vähärautio A, Grénman S, Carpén O, Kauppi L*
Clinical Cancer Research 2018